Afin d’ouvrir la collection et les expositions à l’art contemporain, une résidence d’artiste est créée au musée en 2009, afin de faire se rencontrer le public avec un artiste plasticien. Ces résidences, au rythme d’une par an, ont été l’occasion d’obtenir un soutien du département arts plastiques de la DRAC Franche-Comté sous la forme d’une bourse de production, et de s’inscrire dans la politique régionale de soutien à la création sur le territoire franc-comtois.

Cinq artistes ont été invités: Rémy Marlot , Adam Adach , Françoise Pétrovitch , Jean Stern et Alain Bernardini.

Les œuvres produites dans le cadre de leurs résidences ont été présentées au sein d’expositions personnelles ou collectives: